MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens DM4 plasmid p2METDI

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012989	ACT	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012989	TGTT	2	8	2261	2268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012989	CAA	2	6	2390	2395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012989	ACGG	2	8	2622	2629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012989	TGCT	2	8	2653	2660	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012989	CTG	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012989	ATG	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012989	GCC	2	6	2869	2874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012989	TGA	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012989	CATC	2	8	2944	2951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012989	CGT	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012989	TGC	2	6	2972	2977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012989	AACG	2	8	3039	3046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012989	CATG	2	8	3056	3063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012989	AGA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012989	ACGG	2	8	4221	4228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012989	ATC	2	6	4241	4246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012989	GGA	2	6	5355	5360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012989	TG	3	6	5448	5453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012989	GCC	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012989	CTC	2	6	5508	5513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012989	AGA	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012989	CA	3	6	5560	5565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012989	CGA	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012989	GCG	2	6	5600	5605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012989	CG	3	6	6533	6538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012989	CGGG	2	8	6542	6549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012989	GCA	2	6	6550	6555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012989	CGTT	2	8	6608	6615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012989	TGT	2	6	6711	6716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012989	ACGC	2	8	6744	6751	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012989	CCAC	2	8	7779	7786	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_012989	CGGC	2	8	7793	7800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012989	GTC	2	6	7888	7893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012989	CAA	2	6	8857	8862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012989	CGC	2	6	9851	9856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_012989	GCT	2	6	9942	9947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012989	CAC	2	6	9948	9953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012989	AAGG	2	8	9999	10006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012989	GC	4	8	10036	10043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012989	GCG	2	6	10103	10108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012989	CG	3	6	10127	10132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012989	GCC	2	6	10137	10142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012989	GCG	2	6	10149	10154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012989	TGC	2	6	10161	10166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012989	ATGGC	2	10	10172	10181	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012989	GCC	2	6	10945	10950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_012989	CCG	2	6	10979	10984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_012989	TCG	2	6	11291	11296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012989	A	7	7	11303	11309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012989	GT	3	6	11328	11333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012989	GGTA	2	8	12467	12474	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012989	GAC	2	6	12532	12537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012989	GT	3	6	12539	12544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012989	GGC	2	6	12549	12554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012989	CTG	2	6	14010	14015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012989	GCC	2	6	14061	14066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012989	CAC	2	6	14262	14267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_012989	CAG	2	6	14279	14284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012989	GCCC	2	8	14320	14327	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_012989	CCCA	2	8	14356	14363	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_012989	GCC	2	6	14372	14377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012989	TGC	2	6	14426	14431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012989	GCA	3	9	14452	14460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012989	ACG	2	6	14611	14616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012989	CCG	2	6	14689	14694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_012989	CCG	2	6	18221	18226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012989	GTTG	2	8	18230	18237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012989	CA	3	6	18325	18330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012989	GCC	2	6	20541	20546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012989	GAC	3	9	20567	20575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012989	AG	3	6	20618	20623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012989	TAC	2	6	20633	20638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012989	TGC	2	6	20780	20785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012989	GAAT	2	8	24480	24487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012989	TA	3	6	24489	24494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012989	ATA	2	6	24526	24531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012989	TA	4	8	24534	24541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012989	CCT	3	9	24577	24585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012989	GGA	2	6	24663	24668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012989	TAA	2	6	24675	24680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012989	TA	3	6	24729	24734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012989	AGATA	2	10	24759	24768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012989	TTA	2	6	24795	24800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012989	TAC	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012989	TA	3	6	24927	24932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012989	GAA	2	6	24942	24947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012989	TCCC	2	8	24988	24995	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_012989	G	6	6	25004	25009	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012989	GCA	2	6	25093	25098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012989	CGT	2	6	25187	25192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012989	CCA	2	6	26448	26453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_012989	ATT	3	9	29109	29117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012989	CGG	2	6	29937	29942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012989	ACG	2	6	29983	29988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012989	CATG	2	8	30022	30029	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012989	GCT	2	6	30066	30071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012989	CG	3	6	30099	30104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012989	TCT	2	6	30651	30656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012989	CATG	2	8	30668	30675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012989	GAA	2	6	30679	30684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012989	GGT	2	6	31089	31094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012989	CGG	2	6	31146	31151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012989	GGT	2	6	31213	31218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012989	CGAG	2	8	31226	31233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012989	TGT	2	6	31250	31255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012989	CCT	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_012989	AGA	2	6	31304	31309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012989	CGC	2	6	31478	31483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012989	CCG	2	6	31520	31525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_012989	TGCG	2	8	31535	31542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012989	CGTG	2	8	31610	31617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_012989	GCAG	2	8	31673	31680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012989	CGC	2	6	31744	31749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_012989	CGC	2	6	31788	31793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012989	CT	3	6	31881	31886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012989	TGC	2	6	31918	31923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012989	GGCGC	2	10	31938	31947	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_012989	CG	3	6	33088	33093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012989	GC	3	6	33164	33169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012989	CCT	2	6	33195	33200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012989	GCC	2	6	33301	33306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_012989	TAG	2	6	33326	33331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012989	GTCC	2	8	33456	33463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012989	CGA	2	6	33549	33554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012989	CGGA	2	8	33632	33639	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_012989	CTG	2	6	33669	33674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012989	ACG	2	6	33726	33731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012989	CGC	2	6	33753	33758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012989	CA	3	6	33811	33816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012989	TTTG	2	8	33860	33867	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012989	GAA	2	6	33944	33949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012989	GCG	2	6	33966	33971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012989	CGC	2	6	33973	33978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_012989	GAT	2	6	34466	34471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012989	TTC	2	6	34526	34531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012989	GTG	2	6	34577	34582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012989	CATT	2	8	34640	34647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_012989	CTC	2	6	34665	34670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_012989	TC	3	6	34689	34694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012989	T	6	6	34722	34727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012989	GCCA	2	8	34745	34752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012989	CTC	2	6	34849	34854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_012989	TGC	2	6	34874	34879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012989	GGA	2	6	34950	34955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012989	GT	3	6	34958	34963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012989	GAG	2	6	35826	35831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012989	ATG	2	6	35832	35837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012989	GCGA	2	8	35862	35869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012989	GCC	2	6	35883	35888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_012989	CCGG	2	8	38236	38243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012989	CGG	2	6	38274	38279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_012989	CTT	2	6	38284	38289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_012989	ATG	2	6	38346	38351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012989	CGG	2	6	38409	38414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_012989	GCCCGG	2	12	38431	38442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_012989	CG	3	6	38453	38458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_012989	CG	3	6	38486	38491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_012989	CGA	2	6	38494	38499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_012989	TCG	2	6	38502	38507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_012989	ACG	2	6	38532	38537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_012989	TCG	2	6	38562	38567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.